Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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