Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms