Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXL1Q08397 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms