Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms