Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLEQ07864 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLEQ07864 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLEQ07864 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLEQ07864 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms