Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms