Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms