Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms