Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2Q04721 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms