Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDR2Q01850 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms