Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms