Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD1P98174 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms