Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms