Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms