Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms