Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms