Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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