Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms