Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME5P56597 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms