Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms