Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LUMP51884 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LUMP51884 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LUMP51884 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LUMP51884 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LUMP51884 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms