Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms