Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB28P51157 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB28P51157 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB28P51157 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB28P51157 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms