Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP3P50461 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP3P50461 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP3P50461 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP3P50461 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSRP3P50461 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms