Protein–RNA interactions for Protein: P49747

COMP, Cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMPP49747 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMPP49747 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMPP49747 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMPP49747 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COMPP49747 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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COMPP49747 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COMPP49747 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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