Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPAP49450 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms