Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms