Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSFMP43897 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSFMP43897 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSFMP43897 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSFMP43897 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSFMP43897 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSFMP43897 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms