Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms