Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms