Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD12P35452 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms