Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF4P34130 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF4P34130 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF4P34130 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms