Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms