Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPS1P31327 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPS1P31327 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPS1P31327 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPS1P31327 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms