Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-FP30511 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms