Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP1P28562 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP1P28562 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms