Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHATP28329 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHATP28329 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHATP28329 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHATP28329 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms