Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTR2AP28223 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms