Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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