Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMO2P25791 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMO2P25791 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMO2P25791 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMO2P25791 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMO2P25791 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms