Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRGP23470 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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