Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SPRR1BP22528 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms