Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF1P22415 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF1P22415 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF1P22415 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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