Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1P21675 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1P21675 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1P21675 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1P21675 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1P21675 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF1P21675 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms