Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms