Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB4P16144 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms