Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms