Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms