Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLA1P09884 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLA1P09884 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLA1P09884 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLA1P09884 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLA1P09884 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLA1P09884 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLA1P09884 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLA1P09884 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLA1P09884 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLA1P09884 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms