Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms